Việc bố trí thiết bị làm sạch thứ cấp phải càng gần kênh vận chuyển nguyên liệu chính càng tốt để đảm bảo nguyên liệu đã được làm sạch có thể quay trở lại dòng nguyên liệu chính. Ngoài ra, có thể thêm chất tẩy rửa giai đoạn thứ ba để hoàn tất quy trình làm sạch cuối cùng. Máy làm sạch có thể có cùng thông số kỹ thuật và kiểu dáng như máy làm sạch giai đoạn hai hoặc có thể được điều chỉnh cho phù hợp với các kiểu máy khác tùy theo không gian có sẵn tại chỗ để đạt được hiệu quả làm sạch tốt hơn và quản lý vận hành và bảo trì thuận tiện hơn.
Do loại máy làm sạch này thường được lắp đặt xa trống, nên đặt nó ở điểm tiếp tuyến nơi băng tải rời khỏi trống dỡ. Băng tải ở khu vực này ở trạng thái căng thẳng cao nên không dễ bị biến dạng, điều này có thể tránh được hiệu quả độ lệch lên trên của băng tải do áp suất cạo của chất tẩy rửa, đồng thời ngăn chặn hiệu quả làm sạch bị suy giảm.